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B020968 - METABOLOMICA E PROTEOMICA STRUTTURALE NEL DRUG DISCOVERY
Principali informazioni
Lingua Insegnamento
Contenuto del corso
Metodi Didattici
Modalità di verifica apprendimento
Programma del corso
Anno Accademico 2020-21
Coorte 2020 - Laurea Magistrale in SCIENZE CHIMICHE
Anno di corso
Primo Anno - Secondo Semestre
Dipartimento di Afferenza
Chimica "Ugo Schiff"
Tipo insegnamento
Attività formativa monodisciplinare
Settore Scientifico disciplinare
CHIM/03 - CHIMICA GENERALE ED INORGANICA
Crediti Formativi
6
Ore Didattica
48
Periodo didattico
22/02/2021 ⇒ 11/06/2021
Frequenza Obbligatoria
No
Tipo Valutazione
Voto Finale
Contenuto del corso
mostra
Programma del corso
mostra
Docenza
Lingua Insegnamento
Italiano
Contenuto del corso
Pipeline del drug discovery. Target proteici e non. Costanti di binding e cinetiche. ADMET. Drug design razionale e irrazionale. Fragment-based drug-discovery. Docking in silico. Screening in vitro: fluorimetria, microcalorimetria, surface plasmon resonance. Screening con NMR e X-ray. Metabolomica: definizione, selezione del target e valutazione della risposta individuale. Spettrometria di massa e NMR. Analisi multivariate e univariate. Fenotipo individuale. Applicazioni in campo clinico.
Metodi Didattici
Lezioni frontali ed esercitazioni pratiche.
Modalità di verifica apprendimento
Esame orale.
Programma del corso
La pipeline del drug discovery in era post-genomica. Le fasi cliniche e la farmacogenomica. Brevettazione. Concetto di patologia target, target molecolari; target e pathway. I target classici; interazione fra due proteine come bersaglio .Target proteici e non proteici. Metodi di selezione del target. Definizione di farmaco. Agonisti e antagonisti. Curva dose-risposta. Definizione di costanti di binding e di dissociazione. Relazione con le costanti cinetche. Inibitori suicidi. Cinetiche enzimatiche, schemi cinetici più complessi. Predizioni ADMET. Le 5 "regole del 5" di Lipinski. Drug design razionale e irrazionale. QSAR. Structure-based drug-design. Fragment-based drug-discovery. Considerazioni termodinamiche e guadagno entropico. Anchoring, merging, tethering. Drug-discovery in silico; struttura del target e programmi di docking. SAR by X-ray: soaking e cocristallizzazione. High-throughput screening (HTS) in vitro: fluorimetria, microcalorimetria, surface plasmon resonance. SAR by NMR. Screening con NMR: metodi protein-observed e ligand-observed.
La metabolomica: definizione, ruolo nella selezione del target e nella valutazione della risposta individuale al trattamento (precision medicine). Metodologie analitiche in metabolomica: spettrometria di massa e NMR; vantaggi e svantaggi di ciascun approccio. L’importanza della fase preanalitica. Metodi statistici per il trattamento dei dati: analisi multivariate e univariate. Il fenotipo metabolico individuale. Esempi si applicazioni della metabolomica in campo clinico.
La metabolomica: definizione, ruolo nella selezione del target e nella valutazione della risposta individuale al trattamento (precision medicine). Metodologie analitiche in metabolomica: spettrometria di massa e NMR; vantaggi e svantaggi di ciascun approccio. L’importanza della fase preanalitica. Metodi statistici per il trattamento dei dati: analisi multivariate e univariate. Il fenotipo metabolico individuale. Esempi si applicazioni della metabolomica in campo clinico.