Contenuto del corso
Controllo dell'espressione genica negli eucarioti. Fattori trascrizionali regolativi: Rimodellamento della cromatina. Il silenziamento genico. Fattori Epigenetici. MicroRNA. Organismi e sistemi cellulari modello Differenziametno cellulare e rigenerazione tissutale. Ciclo cellulare e suoi punti di regolazione. Morte cellulare programmata. Autofagia. Citoscheletro e molecole di adesione. Migrazione cellulare e matrice cellulare. Comunicazione tra cellule. Microambiente
Alberts l'essenziale di biologia molecoalre della cellula ; Darnell, Lodish: Biologia molecolare della cellula Ed. Zanichelli
T.A. Brown "Genomi" Ed. Edises
Lewin Benjamin; Il gene VIII; Ed. Zanichelli
J. Watson,Biologia Molecolare del Gene . Ed. Zanichelli
Introduzione alla Genomica”
Gibson e Muse; Zanichelli.
Griffith-Zanichelli- Genetica-Principi di analisi Formale
Hartwell- McGraw-Hill- Dall’analisi formale alla genomica
"Fondamenti di Bioinformatica" Citterich et al. Zanichelli
Obiettivi Formativi
Conoscenza di: terminologia usata in biologia molecolare e cellulare. Basi molecolari dei processi coinvolti nella crescita, morte, adesione e motilità cellulare e fattori coinvolti nella regolazione; basi di biologia cellulare e molecolare relative al controllo della segnalazione cellulare coinvolta nei processi biologici fondamentali
Prerequisiti
Conoscenze di Biologia molecolare di base e Biochimica
Metodi Didattici
CFU:9
Numero di ore totali del corso: 72
Modalità di verifica apprendimento
prova orale
Programma del corso
Controllo dell'espressione genica negli eucarioti: struttura dei promotori trascrizionali e fattori trascrizionali regolativi. Modificazioni della cromatina (rimodellatori della cromatina, swi/sfn, proteine HMG). Regolazione semipermanente e permanente dell'espressione genica (circuiti autoregolativi coinvolti nel differenziamento cellulare). Silenziamento genico e microRNA. Morte cellulare programmata: apoptosi ed autofagia. Molecole coinvolte nell'adesione cellulare: struttura e funzione. Il citoscheletro: struttura e ruolo nella motilità, migrazione cellulare e regolazione dell'espressione genica. Comunicazione cellulare: giunzioni di tipo gap. Metodologie per lo studio della regolazione dell'espressione genica e dei processi biologici quali proliferazione, adesione, motilità, differenziamento, morte cellulare.
Banche dati in genomica, trascrittomica e controllo dell’espressione genica. Teoria e pratica degli allineamenti. Informazione negli allineamenti multipli: motivi, firme, fingerprints, profili, modelli di Markov. Metodi per l’idetificazione di siti di legame di fattori di trascrizione. Metodi per i bersagli dei microRNA. Isole CpG, promotori e gene finding.